国产三级精品三级在线观看,国产高清无码在线观看,中文字幕日本人妻久久久免费,亚洲精品午夜无码电影网

他，20篇Nature正刊！深受諾貝爾獎得主認(rèn)可！冷凍電鏡+神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，新發(fā)Nature Methods！

? 頂刊 ? 閱讀 13
他，20篇Nature正刊！深受諾貝爾獎得主認(rèn)可！冷凍電鏡+神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，新發(fā)Nature Methods！
第一作者：Dari Kimanius
通訊作者：Dari Kimanius，Sjors H. W. Scheres
通訊單位：英國劍橋MRC分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室
他，20篇Nature正刊！深受諾貝爾獎得主認(rèn)可！冷凍電鏡+神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，新發(fā)Nature Methods！
Sjors Scheres，院士，荷蘭結(jié)構(gòu)生物學(xué)家，在荷蘭 Utrecht University 獲得博士學(xué)位。2010年，Sjors Scheres 加入劍橋大學(xué)MRC分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室。
獲得迄今為止最清晰的核糖體圖像，“我的主要貢獻(xiàn)是數(shù)學(xué)方面的“，他的數(shù)學(xué)為結(jié)構(gòu)生物學(xué)帶來了一場革命，深受諾貝爾獎得主Venki Ramakrishnan認(rèn)可，“他一個人呆了幾年，然后就拿出了這個美妙的軟件?！?/span>

論文速覽

冷凍電鏡（cryo-EM）技術(shù)在生物大分子結(jié)構(gòu)測定中受到個體粒子圖像對齊噪聲的限制。較小的粒子信號弱，對齊誤差導(dǎo)致其適用性受到尺寸限制。本研究探索了如何通過應(yīng)用深度學(xué)習(xí)來改進(jìn)圖像對齊，利用關(guān)于生物大分子結(jié)構(gòu)的先驗(yàn)知識，這些知識在數(shù)學(xué)上難以表達(dá)。
研究團(tuán)隊(duì)訓(xùn)練了一個去噪卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，使用來自電子顯微鏡數(shù)據(jù)銀行（EMDB）的半集重建對，并以此去噪器作為常用平滑先驗(yàn)的替代。這種稱為Blush正則化的方法，與現(xiàn)有算法相比，尤其在信噪比較低的數(shù)據(jù)中，能夠產(chǎn)生更好的重建效果。
通過重建一個分子量為40 kDa的蛋白質(zhì)-核酸復(fù)合物，證明了去噪神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)將擴(kuò)大冷凍電鏡結(jié)構(gòu)測定對一系列生物大分子的適用性。
圖文導(dǎo)讀
他，20篇Nature正刊！深受諾貝爾獎得主認(rèn)可！冷凍電鏡+神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，新發(fā)Nature Methods！
圖1：Blush正則化和示例體積切片的示意圖。
他，20篇Nature正刊！深受諾貝爾獎得主認(rèn)可！冷凍電鏡+神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，新發(fā)Nature Methods！
圖2：PfCRT數(shù)據(jù)集的單粒子重構(gòu)。
他，20篇Nature正刊！深受諾貝爾獎得主認(rèn)可！冷凍電鏡+神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，新發(fā)Nature Methods！
圖3：Ste2數(shù)據(jù)集的單粒子重構(gòu)。
他，20篇Nature正刊！深受諾貝爾獎得主認(rèn)可！冷凍電鏡+神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，新發(fā)Nature Methods！
圖4：剪接體數(shù)據(jù)集的多體重構(gòu)。
他，20篇Nature正刊！深受諾貝爾獎得主認(rèn)可！冷凍電鏡+神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，新發(fā)Nature Methods！
圖5：FIA的螺旋重構(gòu)。
他，20篇Nature正刊！深受諾貝爾獎得主認(rèn)可！冷凍電鏡+神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，新發(fā)Nature Methods！
圖6：40 kDa的Aca2-RNA復(fù)合物的單粒子重構(gòu)。
總結(jié)展望
本研究通過Blush正則化方法，提高了冷凍電鏡結(jié)構(gòu)測定的分辨率，尤其是在處理信噪比較低的數(shù)據(jù)時(shí)。通過去噪卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的應(yīng)用，研究團(tuán)隊(duì)能夠重建出之前難以分析的小分子量復(fù)合物的高分辨率結(jié)構(gòu)。
本技術(shù)不僅提高了冷凍電鏡在生物大分子結(jié)構(gòu)分析中的適用性，還為未來在更小尺寸或更復(fù)雜結(jié)構(gòu)的生物分子研究中提供了新的工具。研究結(jié)果表明，去噪神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在冷凍電鏡結(jié)構(gòu)測定中的應(yīng)用前景廣闊，有望進(jìn)一步推動該領(lǐng)域的技術(shù)進(jìn)步。
文獻(xiàn)信息
標(biāo)題：Data-driven regularization lowers the size barrier of cryo-EM structure determination
期刊：Nature Methods
DOI：10.1038/s41592-024-02304-8

原創(chuàng)文章，作者：計(jì)算搬磚工程師，如若轉(zhuǎn)載，請注明來源華算科技，注明出處：http://m.xiubac.cn/index.php/2024/06/13/11d26a2034/

贊 (0)

相關(guān)推薦

安平县| 利辛县| 阿尔山市| 霞浦县| 固阳县| 平安县| 科尔| 繁峙县| 惠州市| 沾益县| 台中市| 定远县| 赣榆县| 大英县| 射洪县| 广安市| 眉山市| 甘谷县| 安达市| 桐城市| 曲麻莱县| 龙里县| 宁德市| 商都县| 邢台县| 梁平县| 万全县| 广州市| 临沭县| 绥中县| 博罗县| 新巴尔虎右旗| 宿迁市| 富蕴县| 福建省| 嘉黎县| 东海县| 长治县| 桦甸市| 锡林浩特市| 怀来县|