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【純計(jì)算】Nature Materials:柔性多孔晶體的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)行為的研究


【純計(jì)算】Nature Materials:柔性多孔晶體的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)行為的研究
本文為新加坡國(guó)立大學(xué)趙丹教授、瑞典斯德哥爾摩大學(xué)黃哲昊博士、日本名古屋大學(xué)松田亮太郎(MATSUDA Ryotaro)教授(共同通訊作者)等人設(shè)計(jì)了一種有機(jī)共價(jià)框架材料,通過實(shí)驗(yàn)研究與密度泛函理論計(jì)算(CASTEP)研究其與分子氣體相互作用的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)現(xiàn)象。
柔性多孔晶體(SPC)是一種特殊類型的客體分子響應(yīng)多孔材料,結(jié)合了高晶體線性和結(jié)構(gòu)可轉(zhuǎn)化性與它們的剛性對(duì)應(yīng)物不同,柔性多孔晶體具有動(dòng)態(tài)變化的孔隙,這些孔隙積極相互作用。這使SPC在氣體吸附、分離和存儲(chǔ)等方面具有優(yōu)勢(shì)。而金屬-有機(jī)框架(MOFs)和COFs是兩種由網(wǎng)狀化學(xué)形成的多孔晶體,大多數(shù)迄今為止報(bào)告的SPC為MOFs。這可能是因?yàn)镸OFs的配位鍵能比千焦通常要低得多。
一些三維(3D)COF顯示出結(jié)構(gòu)變化當(dāng)與某些有機(jī)溶劑或溶劑蒸汽相互作用時(shí),例如四氫鈾和二甲基甲酰胺;然而,開發(fā)其他客戶觸發(fā)的軟/柔性COF仍然是必要的。這是因?yàn)榫哂写髽O性和/或高分子量的分子,如四氫呋喃和二甲基甲酰胺,可以強(qiáng)烈相互作用具有多孔材料,從而產(chǎn)生COF結(jié)構(gòu)的靈活性。相反地具有較小極性和/或較低分子量的分子如CO2,C2H4和C2H2表現(xiàn)出弱得多的客體-框架相互作用。調(diào)查這種互動(dòng)是否可以仍然觸發(fā)COF結(jié)構(gòu)中的靈活性。此外,開發(fā)SPC是為了利用它們的活性客體-框架相互作用來實(shí)現(xiàn)吸附、分離和存儲(chǔ)應(yīng)用。據(jù)我們所知,目前,吸附、分離和儲(chǔ)存溶劑蒸汽的工業(yè)價(jià)值有限。因此非常有利于開發(fā)可由具有工業(yè)價(jià)值的氣體,例如CO2、C2H2和C2H4。
構(gòu)象異構(gòu)是一種立體異構(gòu),其中構(gòu)象可以通過單鍵旋轉(zhuǎn)來相互轉(zhuǎn)換。作為一種特殊一種構(gòu)象異構(gòu),阻轉(zhuǎn)異構(gòu)被定義為具有抑制的單鍵旋轉(zhuǎn),導(dǎo)致不可相互轉(zhuǎn)換阻轉(zhuǎn)異構(gòu)體。研究人員在1922年通過實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)分子中發(fā)現(xiàn)阻轉(zhuǎn)異構(gòu)體攜帶龐大的取代基。以前,分子阻轉(zhuǎn)異構(gòu)體在生物系統(tǒng)和藥物發(fā)現(xiàn)中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。然而,在具有無限框架的晶體中,縮聚仍然很罕見結(jié)構(gòu)。本文表明可以通過控制晶體生長(zhǎng)條件來合成3D COF多孔晶體阻轉(zhuǎn)異構(gòu)體。重要的是,雖然一個(gè)3D COF阻轉(zhuǎn)異構(gòu)行為是剛性的,但另一個(gè)表現(xiàn)出具有多種結(jié)構(gòu)相變行為模式的氣體吸附的靈活性。
計(jì)算方法
本文的計(jì)算部分采用Materials Studio軟件包的CASTEP對(duì)不同氣體吸附能量與結(jié)構(gòu)特性進(jìn)行系統(tǒng)地研究。計(jì)算基于廣義梯度近似(GGA)下的PEB泛函計(jì)算電子交換相關(guān)性,采用平面波超軟贗勢(shì)法描述電子-離子交互作用。在這個(gè)模擬中,以Monkhorst-Pack空間下的2×2×2 k點(diǎn)與截?cái)嗄転?90 eV進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化。通過倫敦散射修正來考慮分子與基體間的Van der Waals相互作用。
結(jié)果與討論
【純計(jì)算】Nature Materials:柔性多孔晶體的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)行為的研究
圖1 通過結(jié)構(gòu)表征與分析合成的COF結(jié)晶度高,具有明顯的晶體結(jié)構(gòu),不同壓力條件下N2吸附測(cè)試表明合成的COF具有不同的結(jié)構(gòu)類型。
【純計(jì)算】Nature Materials:柔性多孔晶體的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)行為的研究
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【純計(jì)算】Nature Materials:柔性多孔晶體的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)行為的研究

圖2、3和4研究在溫度195K下,不同壓力條件下測(cè)試COF-320-A對(duì)不同空間大小的氣體分子C2H4、CO2和C2H2的吸附行為,以及吸附不同氣體含量的結(jié)構(gòu)特性。實(shí)驗(yàn)的測(cè)試研究表明,吸附這些不同的氣體展現(xiàn)出不同的吸附行為以及結(jié)構(gòu)相變特性。

【純計(jì)算】Nature Materials:柔性多孔晶體的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)行為的研究
上述氣體吸附結(jié)果,以及原位PXRD測(cè)量結(jié)果表明,COF-320-A可以表現(xiàn)出對(duì)不同氣體具有不同的孔膨脹類型,先前從未觀察到的類似獨(dú)特行為。為了理解這種行為,本文進(jìn)行了第一性原理密度泛函理論和蒙特卡羅模擬。由于COF-320-A孔隙膨脹具有典型的“閘門打開”特征,團(tuán)隊(duì)采用了Kitagawa等人提出的模型。在該模型中,變形能量(Edef)表示能量閉孔狀態(tài)和沒有吸附分子的開孔狀態(tài)之間的差異。相互作用能量(Eint)代表吸附分子-基體和分子-分子間減少的能量;因此,Eint具有負(fù)值。當(dāng)Eint大于Edef時(shí),出現(xiàn)孔隙膨脹??偰芰浚‥tot)為定義為Edef和Eint的總和。該計(jì)算模型考慮氣體-框架相互作用的能量,并且不考慮其他熵等因素。
本氣體吸附系統(tǒng)中COF-320-A為閉孔態(tài),而開孔狀態(tài)結(jié)構(gòu)是COF-320-AE1,2,3、COF-320-A2和COF-320-A2E1,2。Edef值通過計(jì)算COF-320-A和其他氣體自由操作狀態(tài)之間的能量差結(jié)構(gòu)。Eint是通過計(jì)算不同狀態(tài)的氣體吸附能和氣體數(shù)量來確定的根據(jù)吸附等溫線來計(jì)算每個(gè)開孔態(tài)下的吸附量(圖2-4)。利用這些信息,獲得了不同氣體吸附過程的能量圖譜,如圖5所示。模擬結(jié)果表明,C2H4分子(4.1??)是太大,無法進(jìn)入COF-320-A孔隙(3.7??). 這低壓狀態(tài)下,對(duì)于C2H4分子進(jìn)入COF-320-A通道極其困難,解釋為什么不可能實(shí)現(xiàn)平滑和連續(xù)的孔隙膨脹吸附C2H4分子。然而,C2H4二聚體和COF-320-A孔徑之間的差異僅為0.4??和COF-320-A的熱震動(dòng)能量使得其孔隙具有一定的靈活性。
因此,在更高的壓力下,C2H4與基體的相互作用加劇,可以打開COF-320-A孔隙,使不連續(xù)的“閘門打開”。計(jì)算表明COF-320-A2和COF-320-A之間的Edef為10.1?kcal?mol–1.之后,每個(gè)結(jié)構(gòu)單元平均吸附1.3個(gè)C2H4(圖2a),計(jì)算的Eint為–15.3?kcalmol–1。因此,從COF-320-A到COF-320-A2的結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)變是能量有利的。從COF-320-A2到COF-320-A2E1(圖2g),二次結(jié)構(gòu)相變也得到了類似的結(jié)果),其中平均6C2H4分子被吸附在一個(gè)晶胞中(圖2a)值為-8.9?kcal?mol–1(圖5a)。CO2的分子結(jié)構(gòu)直徑較小(3.3??),與C2H4(4.1??)相比,因此可以直接加載到COF-320-A孔中(3.7??). 這允許孔隙的持續(xù)膨脹,這在能量上是有利的與不連續(xù)的對(duì)應(yīng)物相比。能量計(jì)算表明,只需要少量的二氧化碳吸收(an average of 0.7 CO2 per unit cell)就可以產(chǎn)生足夠的二氧化碳相互作用能量Eint(–6.4?kcalmol–1)來克服Edef并實(shí)現(xiàn)孔隙膨脹(Etot?=–1.4?kcal?mol–1;圖5b)。
結(jié)論與展望
總之,本文合成了COF-320和COF-320-A,具有晶體中的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)現(xiàn)象。不同于分子具有龐大取代基的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)體,基于晶體的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)是由晶格的空間應(yīng)變引起的?;诰w的阻轉(zhuǎn)異構(gòu)也很有趣,因?yàn)樽柁D(zhuǎn)異構(gòu)表現(xiàn)出明顯的特性,提供了一種在不發(fā)生化學(xué)變化的情況下調(diào)整3D COF屬性的替代方法。與剛性COF-320相比,COF-320-A的非傳統(tǒng)氣體吸附財(cái)產(chǎn)推動(dòng)了COF從“剛性”體制到“柔性”體制。特別是COF-320-A的能力為了通過連續(xù)擴(kuò)展其孔隙來識(shí)別不同的氣體,在其他SPC。不同氣體引發(fā)COF-320-A的現(xiàn)象以不同的方式擴(kuò)張可能會(huì)提供另一種逆轉(zhuǎn)機(jī)制氣體吸附選擇性。這些獨(dú)特的特性使柔性COF成為有趣的一類共價(jià)柔性多孔晶體。
文獻(xiàn)信息

Chengjun KangZhaoqiang ZhangShinpei KusakaKohei NegitaAdam K. UsadiDavid C. CalabroLisa Saunders BaughYuxiang WangXiaodong ZouZhehao HuangRyotaro Matsuda & Dan Zhao,Covalent organic framework atropisomers with multiple gas-triggered structural flexibilities. Nat. Mater. (2023)

 https://www.nature.com/articles/s41563-023-01523-2

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