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Nat Chem:東北師大畢錫和課題組基于金屬卡賓實(shí)現(xiàn)吲哚多樣性分子編輯

對(duì)有機(jī)分子進(jìn)行精確的分子編輯,迅速增加分子骨架的多樣性和復(fù)雜性,避免復(fù)雜的多步從頭合成及廢棄物的產(chǎn)生,是現(xiàn)代有機(jī)合成的核心內(nèi)容。近年來(lái),化學(xué)家在C–H鍵官能團(tuán)化(分子外圍編輯)方面取得了巨大的進(jìn)展,而直接修飾、改變分子核心骨架(分子骨架編輯)的進(jìn)展則較為有限。用相同的化學(xué)試劑,同時(shí)對(duì)分子核心骨架和外圍C–H鍵進(jìn)行精確分子編輯的方法更是少之又少。

近期,東北師范大學(xué)畢錫和課題組以氟烷基苯磺酰腙原位生成高活性氟烷基卡賓為工具,通過(guò)反應(yīng)條件的精細(xì)控制,實(shí)現(xiàn)了對(duì)吲哚核心骨架和外圍碳?xì)滏I的精準(zhǔn)分子編輯,高效制備了多種具有潛在醫(yī)學(xué)用途的含氟氮雜環(huán)化合物。

2024年3月5日,相關(guān)成果以“Tunable molecular editing of indoles with fluoroalkyl carbenes”為題發(fā)表在Nature Chemistry期刊上。東北師范大學(xué)劉兆洪副教授和畢錫和教授為通訊作者,博士研究生劉少鵬、楊勇、宋清敏為共同第一作者。

Nat Chem:東北師大畢錫和課題組基于金屬卡賓實(shí)現(xiàn)吲哚多樣性分子編輯

吲哚是藥物分子和天然產(chǎn)物中最常見(jiàn)的含氮雜環(huán)之一,在抗高血壓、抗增殖、抗病毒、抗腫瘤、鎮(zhèn)痛、抗炎、抗菌等多個(gè)治療領(lǐng)域的藥物中占有一席之地,被視為后期分子編輯的理想底物。含氟片段的引入往往能明顯改變分子的物理、化學(xué)、生物學(xué)性質(zhì),即產(chǎn)生所謂的“氟效應(yīng)”。因此,“氟引入”已成為藥物、農(nóng)藥、新材料創(chuàng)制的常規(guī)策略?;诖?,畢錫和教授團(tuán)隊(duì)以氟烷基-N-鄰三氟甲基苯磺酰腙原位生產(chǎn)氟烷基卡賓中間體為工具,通過(guò)反應(yīng)條件的精細(xì)控制,實(shí)現(xiàn)了對(duì)吲哚分子核心骨架和外圍碳?xì)滏I的精準(zhǔn)分子編輯,包括:吲哚骨架的“一碳”插入反應(yīng),2,3-位環(huán)丙烷化反應(yīng),3位C–H鍵偕二氟烯基化反應(yīng)以及串聯(lián)的環(huán)丙烷化/N–H鍵偕二氟烯基化反應(yīng),高效高選擇性地制備了具有潛在藥物用途的含氮雜環(huán)化合物,為構(gòu)建含氟片段的復(fù)雜分子鋪平了道路(圖1)。

Nat Chem:東北師大畢錫和課題組基于金屬卡賓實(shí)現(xiàn)吲哚多樣性分子編輯
圖1:研究背景和反應(yīng)設(shè)計(jì)(圖片來(lái)源:Nat. Chem.)。

吲哚是富電子芳烴,分子結(jié)構(gòu)本身C3位和N1位均具有較高的反應(yīng)活性,在與金屬卡賓反應(yīng)時(shí)可能會(huì)導(dǎo)致產(chǎn)生C2、C3位或N1位官能化產(chǎn)物和環(huán)丙烷化產(chǎn)物的混合物。為了實(shí)現(xiàn)N-無(wú)保護(hù)吲哚與氟烷基卡賓的發(fā)散性分子編輯,必須解決吲哚分子位點(diǎn)選擇性和化學(xué)選擇性問(wèn)題。詳細(xì)的反應(yīng)條件優(yōu)化顯示,使用3倍量吲哚,TpBr3Ag(thf)為催化劑,在80 oC反應(yīng)以96%的產(chǎn)率獲得吲哚“一碳”插入產(chǎn)物3。將吲哚降低至1倍量,N-鄰三氟甲基苯磺酰腙提高至3倍量,在60 oC反應(yīng)以98%產(chǎn)量獲得雙官能化產(chǎn)物5。催化劑和堿對(duì)反應(yīng)亦有影響,將銀催化劑換為銠催化劑,有機(jī)堿氫化鈉換為無(wú)機(jī)堿N,N-二異丙基乙胺時(shí),以92%產(chǎn)量得到3位C–H鍵偕二氟烯基化產(chǎn)物4(表1)。

Nat Chem:東北師大畢錫和課題組基于金屬卡賓實(shí)現(xiàn)吲哚多樣性分子編輯
表1:反應(yīng)條件優(yōu)化(表格來(lái)源:Nat. Chem.)。

銀催化氟烷基卡賓與吲哚“一碳”插入反應(yīng)具有寬泛的底物適用范圍和良好的官能團(tuán)耐受性。各種拉電子基、給電子基以及雜芳環(huán)取代N-鄰三氟甲基苯磺酰腙和吲哚均可以良好至優(yōu)異的產(chǎn)率得到吲哚擴(kuò)環(huán)產(chǎn)物。其中,全氟烷基鏈的引入,以及4-氮雜吲哚和6-氮雜吲哚的成功轉(zhuǎn)化,將對(duì)新藥研發(fā)起到促進(jìn)作用。作者還發(fā)展了一鍋/兩步法,從吲哚出發(fā)快速合成具有季碳中心的四氫喹啉類化合物。為了驗(yàn)證該方法的高效性和實(shí)用性,作者進(jìn)行克級(jí)規(guī)模實(shí)驗(yàn),并對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行了一系列衍生化,得到了多種含三氟甲基的氮雜環(huán)化合物。

Nat Chem:東北師大畢錫和課題組基于金屬卡賓實(shí)現(xiàn)吲哚多樣性分子編輯
圖2:氟烷基卡賓對(duì)吲哚骨架碳插入反應(yīng)研究(圖片來(lái)源:Nat. Chem.)。

隨后作者對(duì)吲哚3位C–H鍵偕二氟烯基化,2,3-位環(huán)丙烷化以及雙官能化反應(yīng)的底物范圍進(jìn)行了詳細(xì)的考察。如圖3a所示,無(wú)論是對(duì)于N-未保護(hù)吲哚還是N-保護(hù)吲哚,含有不同取代基的N-鄰三氟甲基苯磺酰腙均能夠?qū)崿F(xiàn)3位協(xié)二氟烯基化反應(yīng)的高效轉(zhuǎn)化。吡咯2位偕二氟烯基化產(chǎn)物的生成,進(jìn)一步展示出了該方法的普適性。圖3b顯示,雙官能化反應(yīng)也顯示出了較好的官能團(tuán)耐受性。對(duì)于N-保護(hù)吲哚而言,除了3位的協(xié)二氟烯基化反應(yīng),同樣可以實(shí)現(xiàn)2,3-位的去芳構(gòu)化環(huán)丙烷化反應(yīng)。圖3c顯示,無(wú)論是變換吲哚上的取代基,還是更替N-鄰三氟甲基苯磺酰腙上的取代基,甚至是吲哚N原子上的保護(hù)基,如芐基、芳基、特戊?;≒iv)、氨基甲酰基(CONMe2)、叔丁基二甲基甲硅烷基(TBS)等官能化基團(tuán)均可以兼容到該反應(yīng)體系當(dāng)中。

Nat Chem:東北師大畢錫和課題組基于金屬卡賓實(shí)現(xiàn)吲哚多樣性分子編輯
圖3:氟烷基卡賓對(duì)吲哚的外圍編輯反應(yīng)研究(圖片來(lái)源:Nat. Chem.)。

作者通過(guò)偕二氟烯基化產(chǎn)物與苯甲酰肼的環(huán)化反應(yīng),制備合成了2,5-二取代的1,3,4-惡二唑(134),展示了產(chǎn)物的潛在應(yīng)用價(jià)值。鑒于吲哚的骨架編輯和外圍編輯可能促進(jìn)新藥的研發(fā),以及三氟甲基和偕二氟烯基在藥物化學(xué)中的重要性,作者對(duì)兩種從新熱帶植物中分離出來(lái)的天然產(chǎn)物verticillatine B和raputimonoindole B進(jìn)行了多樣性分子編輯反應(yīng),在不同的反應(yīng)條件下,分別實(shí)現(xiàn)了兩種天然產(chǎn)物的“一碳”插入反應(yīng)、3位偕二氟烯基化反應(yīng),以及雙官能化反應(yīng),為吲哚或喹啉類新藥的開發(fā)提供了依據(jù)。

Nat Chem:東北師大畢錫和課題組基于金屬卡賓實(shí)現(xiàn)吲哚多樣性分子編輯
圖4:衍生化實(shí)驗(yàn)、天然產(chǎn)物后修飾及機(jī)理驗(yàn)證試驗(yàn)(圖片來(lái)源:Nat. Chem.)。

為了深入研究反應(yīng)機(jī)制,作者進(jìn)行了系列控制實(shí)驗(yàn)(圖4c和4d)。實(shí)驗(yàn)表明,底物吲哚和N-鄰三氟甲基苯磺酰腙在短時(shí)間內(nèi)(1 h)可以生成環(huán)丙烷化產(chǎn)物。同時(shí),N-TBS保護(hù)的環(huán)丙烷產(chǎn)物可在室溫下脫除TBS基團(tuán)進(jìn)而轉(zhuǎn)化為插碳產(chǎn)物。這些結(jié)果均表明,插碳反應(yīng)過(guò)程可能經(jīng)歷環(huán)丙烷中間體。此外,實(shí)驗(yàn)表明NaH在開環(huán)反應(yīng)過(guò)程中是必不可少的,反應(yīng)溶劑中微量的水協(xié)助參與了質(zhì)子化過(guò)程。

為了進(jìn)一步探究反應(yīng)機(jī)制,作者進(jìn)行了理論計(jì)算研究。當(dāng)使用Rh2(OAc)4-DIPEA催化體系時(shí),DIPEAH+能夠促進(jìn)β-F消除過(guò)程優(yōu)先發(fā)生,生成C3位偕二氟烯基化產(chǎn)物。該過(guò)程中DIPEA和F原子之間的氫鍵能夠降低吉布斯自由能。而TpBr3Ag–NaH催化劑體系中不存在這種氫鍵效應(yīng),優(yōu)先發(fā)生C2,C3位環(huán)丙烷化過(guò)程。當(dāng)吲哚過(guò)量時(shí),環(huán)丙烷中間體IntIII經(jīng)過(guò)NaH拔氫,可逆開環(huán)以及水協(xié)助質(zhì)子化過(guò)程,得到“一碳”插入產(chǎn)物。當(dāng)N-鄰三氟甲基苯磺酰腙過(guò)量時(shí),形成動(dòng)力學(xué)上有利的葉立德中間體IntIV1,再經(jīng)歷β-F消除過(guò)程得到雙官能化產(chǎn)物,這與實(shí)驗(yàn)結(jié)果均保持一致。

Nat Chem:東北師大畢錫和課題組基于金屬卡賓實(shí)現(xiàn)吲哚多樣性分子編輯
圖5:反應(yīng)機(jī)理研究(圖片來(lái)源:Nat. Chem.)。

綜上所述,東北師范大學(xué)畢錫和教授團(tuán)隊(duì)N-鄰三氟甲基苯磺酰腙作為氟烷基卡賓前體,在銀或者銠催化下實(shí)現(xiàn)了對(duì)吲哚分子的可控分子編輯反應(yīng),反應(yīng)具有高效、高選擇性、高官能團(tuán)容忍度等優(yōu)點(diǎn)。此項(xiàng)工作,再次證明了N-鄰三氟甲基苯磺酰腙作為卡賓前體的顯著優(yōu)越性(Acc. Chem. Res.2022, 55, 1763)。

相關(guān)論文信息:

https://doi.org/10.1038/s41557-024-01468-2

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