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來源丨誠信科研、iNature

2023年2月17日，西湖大學(xué)施一公及張曉峰共同通訊在Nature Communications?在線發(fā)表題為“Mechanisms of the RNA helicases DDX42 and DDX46 in human U2 snRNP assembly”的研究論文，該研究揭示了人U2 snRNP 組裝中RNA解旋酶DDX42和DDX46的作用機制。該研究報道了DDX42-SF3b復(fù)合物的冷凍電鏡結(jié)構(gòu)和含有DDX42 (DDX42-U2復(fù)合物)的17S U2 snRNP的組裝前體。DDX42通過N端序列錨定在SF3B1上，其N-plug占據(jù)SF3B1的RNA通路。DDX42與SF3B1的結(jié)合模式與DDX46的結(jié)合模式有著驚人的相似。

在DDX42-U2復(fù)合物中，DDX42的N端仍然錨定在SF3B1上，但解旋酶結(jié)構(gòu)域已被U2 snRNA和TAT-SF1取代。通過體外實驗，作者發(fā)現(xiàn)DDX42和DDX46在與SF3b的結(jié)合方面是互斥的。SF3B1的癌癥驅(qū)動突變靶向RNA路徑中直接與DDX42和DDX46相互作用的殘基。這些發(fā)現(xiàn)揭示了DDX42和DDX46在17S U2 snRNP組裝中的不同作用，并為SF3B1癌癥突變的機制提供了見解。

另外，2023年1月13日，西湖大學(xué)施一公、黃高興宇及曾超共同通訊在Current Opinion in Structural Biology??在線發(fā)表題為“Structure of the nuclear pore complex goes atomic”的綜述文章，該綜述總結(jié)了最近在破譯NPC分子細節(jié)方面的進展，這些進展在快速發(fā)展的冷凍電鏡技術(shù)、X射線晶體學(xué)和機器學(xué)習(xí)支持的結(jié)構(gòu)預(yù)測方面得到了極大的進展。最近在冷凍電鏡(cryo-EM)重建、機器學(xué)習(xí)支持的結(jié)構(gòu)預(yù)測和生化重建方面的突破結(jié)合起來，以前所未有的精度生成了NPC的分子模型。此外，在細胞冷凍電子斷層掃描(cryo-ET)結(jié)構(gòu)揭示了NPC的實質(zhì)性結(jié)構(gòu)動力學(xué)。這些進步使NPC大的組織原則和職能更加清晰。

施一公團隊近10年在Nature/Cell/Science等已發(fā)表76篇文章

2023年1月2日，西湖大學(xué)施一公團隊在Cell Research（IF=46）在線發(fā)表題為“LilrB3 is a putative cell surface receptor of APOE4”的研究論文，該研究表明LilrB3是APOE4的假定細胞表面受體。該研究證明APOE4，而不是APOE2，特異性地與白細胞免疫球蛋白樣受體B3 (LilrB3)相互作用。LilrB3胞外結(jié)構(gòu)域(ECD)的兩個離散免疫球蛋白樣結(jié)構(gòu)域識別APOE4的N端結(jié)構(gòu)域(NTD)上帶正電荷的表面斑塊。該原子結(jié)構(gòu)揭示了兩個APOE4分子如何特異性地與兩個LilrB3分子結(jié)合，通過形成異質(zhì)四聚體復(fù)合物將它們的細胞內(nèi)信號基元靠近。與生化和結(jié)構(gòu)分析一致，APOE4，而不是APOE2，以Lilrb3依賴的方式激活人類小膠質(zhì)細胞(HMC3)進入促炎狀態(tài)。總之，該研究確定LilrB3可能是APOE4的免疫細胞表面受體，而不是APOE2，這可能有助于理解APOE亞型的生物學(xué)功能和疾病相關(guān)性。

最后，iNature編輯部結(jié)合Pubmed及Web of Science發(fā)現(xiàn)施一公團隊從2014年到2023年（截至2023年3月23日）在Nature?（4篇），Science?（14篇），Cell?（7篇），Cell Research?（9篇），PNAS（15篇），Nature Communications?（3篇），Protein Cell?（3篇）及CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY?（5篇）等發(fā)表76篇文章（包括綜述及研究論文，通訊作者的有68篇文章）（文章后附列表），專注于剪接復(fù)合物，核孔復(fù)合物及分泌酶等的結(jié)構(gòu)解析。另外，由于時間匆忙，如有錯誤，可向編輯部反饋。

76篇文章列表如下：

原文鏈接：

https://www.nature.com/articles/s41467-023-36489-x

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施一公團隊近10年在Nature/Cell/Science等已發(fā)表76篇文章

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