小伙伴們,MS楊站長特訓營繼續(xù)發(fā)車,本期主題:LAMMPS、Materials Studio、Python強強聯(lián)合,buff疊滿!
帶你入門分子動力學模擬、建模與分析!
本期將為大家展示聚合物建模+LAMMPS分子動力學模擬+分析方法:
1. Materials Studio建模聚合物分子鏈;
3. Python生成隨機分布的amorphous聚合物初始結構;
4. 聚合物的分子動力學模擬:包括軟勢,退火,動力學;
5. 采用Python和MDAnalysis對軌跡進行性能分析:包括MSD(和擴散系數(shù)有關),拉伸力學性能,和拉伸過程中鏈取向。
分子動力學軟件中,LAMMPS大尺度原子/分子并行模擬工具,是名副其實的全能巨無霸,能夠實現(xiàn)對百萬級原子分子體系的計算。
LAMMPS應用范圍極廣,可以對氣態(tài)、固態(tài)、液態(tài)進行分子動力學模擬,可調(diào)用多種勢函數(shù)/力場,支持各種系綜、粗?;軌驅崿F(xiàn)對百萬級原子分子體系的計算。
本次特訓營中,將包含Python建模和數(shù)據(jù)分析干貨!LAMMPS與Python結合后,應用更加靈活。
Python+MDAnalysis隨機填充構建聚合物薄膜
特訓營另一個重點內(nèi)容就是建模:可以通過Materials Studio、CHARMM-GUI構建聚合物模型,通過Python工具簡單實現(xiàn)構建指定數(shù)量和密度的聚合物隨機分布初始模型。
本期課程將更加關注聚合物的模擬和分析,利用LAMMPS模擬可以從微觀分子尺度上探究聚合物力學和動力學性能的變化,同時可以觀察應變誘導聚合物鏈發(fā)生取向。
王老師:華算科技LAMMPS授課老師,擁有六年以上LAMMPS軟件使用經(jīng)驗。目前于荷蘭格羅寧根大學進行交流訪問學習。發(fā)表SCI共9篇,并參與編著英文書籍《Fundamentals of Multiscale Modeling of Structural Materials》。
主要研究領域為:利用分子動力學模擬方法,① 研究金屬(梯度和中、高熵合金)及其納米復合材料的力學性能;② 開發(fā)高分子和石墨烯的粗?;P停⒀芯扛叻肿蛹捌浼{米復合材料的結構、力學性能。
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