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實名舉報師兄博士論文造假!

來源 | 知乎專欄

https://zhuanlan.zhihu.com/p/371018409

近日,網(wǎng)曝復(fù)旦大學(xué)某呂姓博士論文數(shù)據(jù)造假,同門師弟無法重復(fù)數(shù)據(jù)。本文僅限轉(zhuǎn)載,而且此事已過去10年之久,為何此時曝出,尚有疑問,具體調(diào)查結(jié)果以官方為準。

實名舉報師兄博士論文造假!

我是在2010年10月正式進入趙**在上海植生所的實驗室進行博士后研究。我沒有想到的是這段博后時光卻成為我科研人生的一段噩夢。我進站之后做的第一個課題是順著趙**在復(fù)旦大學(xué)招收的博士生呂**在博士期間發(fā)表的文章往下做。該文章刊登在JBC (2010) 285: 28076-28085。

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圖 1 呂**JBC文章的題目及相關(guān)圖(原文中的圖4)

我的課題計劃是研究在M. smegmatis菌中mazG基因在氧化壓力下受同一操縱子基因tetR轉(zhuǎn)錄調(diào)控的分子機制,目的是想看mazG的表達在H2O2氧化條件下是否受到TetR的調(diào)控。然而,從2010年的9月份一直到2011年的3月份,我一直無法重復(fù)出呂**JBC文章中圖4的實驗結(jié)果(圖1),也就是說,我沒有看到mazGrelA在H2O2刺激下表達增加。隨后,呂**自己重復(fù)了3次也沒有重復(fù)出他的結(jié)果(其中兩次是我跟隨他一起做的)。隨后我決定采用在H2O2刺激下高表達的基因katGfurA作為陽性對照來繼續(xù)驗證他的實驗,我發(fā)現(xiàn)在我能夠重復(fù)出katGfurA在氧化條件下(5mM或10mM H2O2)高表達的同時,mazGrelA依然沒有出現(xiàn)高表達(圖2A)。我把我的實驗結(jié)果發(fā)給趙**及實驗室其他人之后,大家立刻明白是怎么回事了,但趙**只是終止了這個項目,沒有撤稿,也沒有公開承認呂**偽造實驗數(shù)據(jù)。實驗室大小負責(zé)人多次暗示或明確表示我(們)不要把這個事情張揚出去。趙**在2011年9月份給我的郵件中明確暗示了呂**的文章有問題。

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圖 2 (A)我在2011年的RT-PCR實驗結(jié)果,結(jié)果顯示katGfurA在H2O2誘導(dǎo)下高表達,而mazGrelA并沒有出現(xiàn)高表達,反而是一定程度的降低表達。(B)我從PLoS ONE 10(7): e0134596附加材料中得到的實驗數(shù)據(jù)做出來的直方圖,同樣顯示mazGrelA在H2O2誘導(dǎo)下表達是降低,而不是增高的。

從2010年9月-2011年9月,我重復(fù)了大約40次左右實驗,作者本人呂**重復(fù)了3次,都沒有一次能夠重復(fù)出JBC文章中的結(jié)果。每次重復(fù)我都是從培養(yǎng)M. smegmatis開始,H2O2誘導(dǎo),抽提RNA,做反轉(zhuǎn)錄,然后做RT-PCR或者熒光定量PCR,一輪下來,差不多快一周時間,每次抽提RNA都會用到很多有一定毒性的試劑:苯酚和氯仿,我真的抽得快要吐血了。另外,呂**在他自己進行重復(fù)他的實驗結(jié)果之前(也就是我要跟隨他一起去上海市公共衛(wèi)生中心做這些實驗之前)的某一天,突然他打電話給我,大意是說我這樣做對他不好,學(xué)校知道了會怎樣怎樣的。當(dāng)時我只是覺得他說的話很蹊蹺,并沒有多想。在整個過程中,呂**拒絕給我看他的博士論文和任何實驗記錄。該項目之后,我在趙**實驗室做的第二個項目在已經(jīng)做了很長時間并有部分實驗結(jié)果的情況下突然無緣無故被終止,其目的就是讓我在科研上起不來,從而也就不敢向外界公開此事。而呂**在兩輪博士后結(jié)束之后,以一篇并列第一作者(排第2位置)的PLoS ONE (2008),一篇數(shù)據(jù)造假的JBC和一篇并列第一作者的PLoS Pathogens (2013),于2015年9月在趙**的安排下進入復(fù)旦大學(xué)醫(yī)學(xué)院任副教授至今。

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圖3 (A)mazG所在操縱子示意圖,在氧化條件下,TetR結(jié)合在自己的啟動子上抑制mazG-mfd-tetR的表達(FEBS Letters文章已證實)。(B)我從PLoS ONE 10(7): e0134596附加材料中得到的實驗數(shù)據(jù)做出來的直方圖,進一步說明了在氧化條件下mazG-mfd-tetR是低表達的。(C)是FEBS Letters 594(17): 2867-2880文章通過實驗說明了雖然mazG在氧化條件下對M. smegmatis具有一定的保護作用,但同時也說明了在氧化條件下,mazG的表達是受TetR (Rv1019)抑制的。

幸運的是,該事情過去近10年間,我查閱到有兩篇文章直接支持了我的結(jié)果,進一步說明了呂**在JBC文章中數(shù)據(jù)造假。這些文章也讓我有更多的勇氣來向大眾陳述揭發(fā)此事。在2015年,中科院微生物所課題組發(fā)表在PLoS ONE 10(7): e0134596上的文章“Distinct Responses of Mycobacterium smegmatis?to Exposure to Low and High Levels of Hydrogen Peroxide”進一步提供了直接的證據(jù)。作者采用轉(zhuǎn)錄組學(xué)的方法研究在低濃度(0.2 mM)和高濃度(7 mM)H2O2誘導(dǎo)條件下M. smegmatis體內(nèi)基因轉(zhuǎn)錄情況。該研究結(jié)果顯示,在7 mM H2O2誘導(dǎo)條件下,katGfurA高表達,而mazGrelA并沒有出現(xiàn)高表達(圖2B)。這個實驗結(jié)果進一步支持我的實驗結(jié)果,同時也說明了呂**JBC文章圖4的結(jié)論完全是偽造的。

2020年,F(xiàn)EBS Letters 594(17): 2867-2880上發(fā)表了“Mycobacterium tuberculosis?TetR family transcriptional regulator Rv1019 is a negative regulator of the?mfdmazG?operon encoding DNA repair proteins.” 這篇文章主要內(nèi)容其實就是我原本在2010年博士后階段要做的那個課題,終于該課題在2020年被印度的一個實驗室完成了。在該論文中,作者發(fā)現(xiàn)在M. smegmatis體內(nèi),TetR結(jié)合到它自己的啟動子上,負調(diào)控tetRmfdmazG操縱子表達(圖3A)。并且,作者還發(fā)現(xiàn)雖然mazG對于M. smegmatis在氧化條件下的生存有一定的幫助,但是在氧化條件下TetR是結(jié)合在它自己的啟動子上的,因而mazG的表達會降低(圖3C-D)。這個結(jié)論同樣得到前述2015年P(guān)LoS ONE上文章的支持,在氧化條件下,tetR-mfd-mazG的表達是都降低的(圖3B)。這個證據(jù)進一步直接證明了那篇JBC文章上圖4的實驗結(jié)果是不可能發(fā)生的。

那篇JBC文章發(fā)表10年過去了,我查看了所有引用那篇文章的研究論文,沒有一篇文章證實在氧化條件下,M. smegmatis體內(nèi)的mazGrelA會高表達。不僅如此,對于所有研究Mycobacterium這個種屬mazG基因的相關(guān)論文,我也沒有看到有報道其在氧化環(huán)境下會高表達。

這段經(jīng)歷雖然過去大約10年了,但是對我的傷害可以說是巨大的。你們可以想象,師兄論文造假,師弟卻在那里一遍又一遍的重復(fù),長時間地呼吸著苯酚和氯仿的有毒刺激性氣味,重復(fù)不出來,他就說你的實驗技術(shù)不行。最后做出來了陽性結(jié)果,課題嘎然而止,造假者不僅沒有得到懲治,卻對我是百般欺壓。你們告訴我,人性的底線在哪里?一個師兄挖了一個坑,然后師弟無意之中掉入了他挖的坑里,他每天看著你在坑里掙扎,這是人做的事情嗎?如果一個人的人性如此之壞,做科研的意義是什么?在高校從事教育工作的意義是什么?

每每想起此事,我的心頭就象是壓著一塊巨石一樣,眼淚常常不由自主地就留下來。所以,我愿意把這段經(jīng)歷公之于眾,讓大家來評判,讓大家來吸取教訓(xùn)。事件結(jié)果受到傷害的只有我和科學(xué),科學(xué)不會說話,那就讓我來說吧。

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