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Nature:高被引文章無法重復(fù),怎么破?

Nature:高被引文章無法重復(fù),怎么破?可復(fù)制性(重復(fù)實驗時獲得相同結(jié)果的能力)是科學(xué)的基礎(chǔ)。但在許多研究領(lǐng)域,事實證明這很難實現(xiàn)。現(xiàn)在,一組重要且備受期待的研究論文表明,在癌癥生物學(xué)中進行和解釋復(fù)制研究是多么復(fù)雜、耗時和困難。
近十年前,弗吉尼亞州夏洛茨維爾非營利性開放科學(xué)中心和總部位于加利福尼亞州帕洛阿爾托的研究服務(wù)公司ScienceExchange組織的研究團隊開始系統(tǒng)地測試是否可以復(fù)制著名科學(xué)期刊上高引用論文中的特定實驗。這項工作是備受矚目的可復(fù)制性項目:癌癥生物學(xué)(RPCB)倡議的一部分。研究人員記錄了七項實驗結(jié)果或“效果”;其中五項可以進行數(shù)值測量。總體而言,46%復(fù)制成功,因為這些指標(biāo)有三個或更多指標(biāo)評分,例如結(jié)果是否在實驗預(yù)測的置信區(qū)間內(nèi),還是保留了統(tǒng)計意義。
Nature:高被引文章無法重復(fù),怎么破?
該項目是在制藥公司報告稱他們無法復(fù)制在許多癌癥生物學(xué)論文中的發(fā)現(xiàn)后啟動的。但這些報道沒有指明論文的名稱,也沒有說明復(fù)制的標(biāo)準(zhǔn)。RPCB的設(shè)想是為這種回顧性復(fù)制研究帶來嚴(yán)格的標(biāo)準(zhǔn)。

初步調(diào)查結(jié)果

最清晰的發(fā)現(xiàn)之一是,實驗治療的效果,如殺死癌細胞或縮小腫瘤,復(fù)制效果要小得多,總體而言比最初報告的要小85%。很難知道為什么。例如,可能存在統(tǒng)計學(xué)僥幸;原始研究或復(fù)制中存在偏差;或復(fù)制者缺乏專業(yè)知識,導(dǎo)致重復(fù)研究遺漏了原始研究的一些基本質(zhì)量。

該項目也比預(yù)期的要長五年多,盡管花費了額外的時間,但團隊只能評估他們最初計劃涵蓋的實驗的四分之一。這說明了一個事實,即此類評估花費的時間和精力比預(yù)期的要多得多。
RPCB研究的預(yù)算為在三年內(nèi)花費130萬美元。這增加到了150萬美元,不包括人事或項目管理費用。
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在選定的53篇論文中,沒有一篇包含足夠的細節(jié),供研究人員重復(fù)實驗。因此,復(fù)制者必須聯(lián)系作者以獲取信息,例如注射了多少細胞,通過什么途徑,或者使用的確切試劑。通常,這些細節(jié)甚至連作者都無法提供,因為信息沒有記錄下來或?qū)嶒炇页蓡T已經(jīng)離職。三分之一的作者要么拒絕了更多信息的請求,要么沒有回復(fù)。在評估的193項實驗中,復(fù)制者還必須向原始作者索取關(guān)鍵試劑(如細胞系、質(zhì)?;蚰P蜕铮?,因為他們無法購買或從存儲庫中獲得。大約69%的作者愿意分享他們的試劑。

開放性和準(zhǔn)確性

自可復(fù)制性項目開始以來,鼓勵作者分享他們研究的更精確的方法細節(jié)。Nature與其他期刊一起,于2013年推出了可復(fù)制性清單。它要求作者報告關(guān)鍵的實驗數(shù)據(jù),如所用動物的菌株、年齡和性別。還鼓勵作者將其實驗方案存儲在存儲庫中,以便其他研究人員可以獲得它們。

此外,2012年發(fā)布了“Landis 4”標(biāo)準(zhǔn),以促進嚴(yán)格的動物研究。它們包括對致盲、隨機化和統(tǒng)計評估樣本大小的要求。注冊報告是另一個關(guān)鍵發(fā)展,這是研究人員在進行實驗之前發(fā)布研究設(shè)計的文章格式。這意味著“無效實驗”更有可能發(fā)布,而不是埋在文件抽屜中。項目團隊發(fā)現(xiàn),“無效實驗”更有可能被復(fù)制;80%的此類研究通過三個指標(biāo),而“積極結(jié)果”僅為40%。
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更難解決的事實是,在一個實驗室有效的東西可能在另一個實驗室不起作用,這可能是因為固有的差異或方法上的差異沒有觀察到。以下為例:一項研究跟蹤了某種類型的細胞是否有助于腫瘤的血液供應(yīng)。跟蹤這些細胞需要它們表達“報道”分子(在這種情況下,是綠色熒光蛋白)。但是,盡管進行了多次嘗試和調(diào)整,復(fù)制團隊仍然無法使“報道”分子在要跟蹤的細胞中足夠活躍,因此復(fù)制嘗試被停止了。
RPCB團隊與原始作者一起審查了復(fù)制協(xié)議,并對其進行了同行審查。但關(guān)于實驗設(shè)計的詳細預(yù)先協(xié)議本身并不一定能解釋重復(fù)研究時遇到的挫折。這就是為什么美國國防高級研究項目局(DARPA)使用另一種復(fù)制方法。在一個DARPA項目中,為研究團隊分配了獨立的驗證團隊。研究團隊必須幫助驗證團隊進行故障診斷和支持,以便在工作發(fā)布之前,在另一個實驗室獲得關(guān)鍵結(jié)果。這種方法包含在方案要求中:分配給研究方案的資金的3-8%用于此類核查工作。
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這些研究還表明,研究人員、研究資助者和出版商必須更認真地對待復(fù)制研究。研究人員需要參與此類行動,資助者必須增加對這些研究的投資,出版商也必須發(fā)揮作用,以便研究人員能夠確信這項工作很重要。值得稱贊的是,宣布該項目結(jié)果的新聞發(fā)布會包括美國國家科學(xué)、工程和醫(yī)學(xué)學(xué)院以及國家衛(wèi)生研究院領(lǐng)導(dǎo)人的講話和贊揚。但該項目由德克薩斯州休斯頓的慈善投資基金阿諾德風(fēng)險投資公司資助。
整個科學(xué)界必須認識到,不是為了重復(fù)而重復(fù),而是為了獲得對科學(xué)進步至關(guān)重要的保證:觀察或結(jié)果足夠可信,可以啟發(fā)未來的工作。下一波復(fù)制工作應(yīng)旨在使這工作更容易實現(xiàn)。

原文鏈接

https://www.nature.com/articles/d41586-021-03736-4

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